Story
Nach den Ereignissen der komischen Verbindung Halo: Aufstand stürzt der Master Chief in Ostafrika ab, wo er von Johnson und dem Arbiter gefunden wird. Der Chief, Johnson und die Firma kämpfen im Dschungel gegen den Bund und kommen zu einem Außenposten des UN-Sicherheitsrates. Hier planen Keyes und Lord Hood eine letzte Anstrengung, um den Anführer des Bundes, den Hohen Propheten der Wahrheit, davon abzuhalten, ein Forerunner-Artefakt zu aktivieren, das außerhalb der Ruinen der Stadt New Mombasa entdeckt wurde. Der Häuptling klärt die Abwehr des Luftverbandes, damit Hood die letzten Schiffe der Erde gegen den Propheten führen kann, aber die Wahrheit aktiviert das vergrabene Artefakt und schafft ein Slipspace-Portal, das er und seine Anhänger betreten. Ein von der Flut befallenes Schiff stürzt in der Nähe ab; Elitetruppen kommen an und verglasen die von der Flut befallenen Gebiete der Erde und stoppen die Bedrohung. Nach einer Nachricht, die Cortana an Bord des Flutschiffes hinterlassen hat, folgen der Chief, Arbiter, Elites, Johnson, Keyes und ihre Truppen der Wahrheit durch das Portal. Mit dabei ist 343 Guilty Spark, der dem Chief hilft, da er nach der Zerstörung seiner Ringwelt keine Funktion zu erfüllen hat.
Auf ihrer Reise durch das Portal entdecken die Menschen und Eliten eine riesige künstliche Struktur, die als Arche bekannt ist, weit über die Grenzen der Milchstraße hinaus. Hier kann die Wahrheit alle Halos aus der Ferne aktivieren. Die Sintflut kommt mit voller Kraft an Bord der High Charity und beginnt, die Anlage zu befallen. Die Wahrheit erfasst Johnson, da er einen Menschen braucht, um die Forerunner-Technologie zu nutzen. Keyes wird bei einem Rettungsversuch getötet und Johnson ist gezwungen, die Ringe zu aktivieren. Gravemind schmiedet einen Waffenstillstand mit dem Chief und dem Arbiter, um die Wahrheit zu stoppen. Der Arbiter, Master Chief und die Flutkräfte kommen und überwältigen die Wachen der Wahrheit, retten Johnson und stoppen die Aktivierung der Anlagen. Nachdem der Schiedsrichter die Wahrheit getötet hat, schaltet Gravemind den Häuptling und den Schiedsrichter ein.
Der Chief, Arbiter und Guilty Spark entdecken, dass die Arche einen weiteren Halo baut, um denjenigen zu ersetzen, den der Chief zuvor zerstört hat. Der Häuptling beschließt, diesen Halo zu aktivieren; die Ringwelt würde den Flutbefall auf der Arche beseitigen und gleichzeitig die Galaxie vor der Zerstörung bewahren. Um den Ring zu aktivieren, rettet der Häuptling Cortana, der den Aktivierungsindex des zerstörten Halo hat, aus der High Charity und zerstört die Stadt. Auf dem neuen Halo angekommen, warnt Cortana, dass Gravemind versucht, sich auf dem Ring wieder aufzubauen. Der Chief, Arbiter und Johnson reisen zu Halo’s Kontrollraum, um den Ring zu aktivieren. Guilty Spark erklärt, dass, da der Ring noch nicht vollständig ist, eine vorzeitige Aktivierung ihn und die Arche zerstört. Als Johnson seine Warnung ignoriert, verwundet ihn Guilty Spark tödlich, um “seinen” Ring zu schützen. Der Häuptling zerstört den schuldigen Funken, aktiviert den Ring und entkommt der Selbstzerstörung des Rings auf der Fregatte “Vorwärts bis zum Morgengrauen” des UN-Sicherheitsrates. Allerdings führt die Kraft von Halos Explosion dazu, dass das Slipspace-Portal zusammenbricht, was dazu führt, dass nur die vordere Hälfte von Forward Unto Dawn den Arbiter trägt und zur Erde zurückkehrt.
Auf der Erde findet ein Gedenkgottesdienst für die gefallenen Helden des Mensch-Bund-Krieges statt, bei dem der Schiedsrichter und Lord Hood kurz Worte über den gefallenen Meisterhäuptling austauschen. Nach dem Gedenkgottesdienst brechen der Arbiter und seine Elitebrüder zu ihrem Heimatplaneten Sanghelios auf. Währenddessen driftet die hintere Hälfte des Forward Unto Dawn im unbekannten Raum. Cortana lässt ein Notsignal fallen, räumt aber ein, dass es viele Jahre dauern kann, bis sie gerettet werden. Der Häuptling geht in den Kälteschlaf und sagt Cortana, sie soll mich “wecken, wenn du mich brauchst”. Wenn das Spiel im Schwierigkeitsgrad Legendär abgeschlossen ist, zeigt die Szene weiterhin das Stück von Forward Unto Dawn, das auf einen unbekannten Planeten zusteuert und in der Fortsetzung als “Requiem”, der primären Einstellung der Kampagne von Halo 4, enthüllt wird.