Story
Während das Spiel nur zwanzig Jahre nach seinem Vorgänger spielt, ist die Welt von Tiberian Sun ganz anders. Das tödliche Tiberium infiziert die Welt immer schneller, was den größten Teil der Erde für den Menschen unbewohnbar gemacht hat. Um zu überleben, ist die GDI in die arktischen Regionen der Welt gezogen, während die NOD ihr Lager unter der Erde aufgeschlagen hat.
Die Geschichte des Spiels wird durch die unterschiedlichen Tore zwischen GDI und NOD bestimmt. GDI ist bestrebt, den Weltfrieden aufrechtzuerhalten und die Wurzel des Tiberiums zu entdecken, und ist bestrebt, die Weltherrschaft zu erlangen. Die Geschichte wird durch den offensichtlichen Verlust von Kane, dem Anführer der NOD, am Ende des ersten Tiberianischen Krieges kompliziert, der die Bruderschaft in ein führerloses Durcheinander gestürzt hat, aber sie noch nicht mitgerechnet, da NOD durch genetische Mutation über Tiberium eine Reihe von ultra-mächtigen Einheiten geschaffen hat, die den Mangel an Organisation des Clans mehr als ausgleichen.